曼努埃尔回到家，将德·索萨伯爵的信交给若奥，在这封信的内容里，德·索萨伯爵对国王没能够采纳他的建议将若奥招入海军表示遗憾，但伯爵始终相信若奥的心是和国家和皇室连在一起，德·索萨伯爵表示他将会利用一切机会推荐若奥进入皇家海军任职，以拉近若奥和宫廷的距离。伯爵的信真挚而热烈，若奥也从字里行间体会到德·索萨伯爵的良苦用心，若奥对进入海军已经不抱任何希望，看到信的内容，他露出一丝苦笑，此时的他只希望曼努埃尔能够得到皇室和国王的器重。

    曼努埃尔在家休整了几个月，一直到一五七五年初才准备出发。在这期间，船队将从印度和非洲运回的黄金、象牙和香辛料换成金币，所有参加这次远航的水手都得到一份丰厚的酬劳，并且可以自愿选择是否参加下次前往东方的航海。经过了漫长的一年多的航行，又得到了巨额的报酬，曼努埃尔的水手们显得十分忠诚，他们表示非常愿意继续留在船队里效力，一起前往东方航行，曼努埃尔也承诺这些水手，在从东方平安返回后，他们将可能得到更多的回报。

    费南多在一个月里异常忙碌，他年轻的儿子也快十五岁了，对于一个中年得子又经常远离家的人说，能够和家人待在一起的时间十分宝贵。费南多一面安排水手们忙着整修船只，交易货物，一面尽量多抽出时间和自己的家人在一起。和费南多一样，路易斯和西蒙也尽量利用时间多陪陪他们的家人，通常只有塞西尔和班吉特留在船上，不过他们并不孤独，曼努埃尔经常返回船队，和塞西尔和班吉特聊天，以便了解奥斯曼人和非洲人的生活境况，也想通过这样的方式了解不同的风土人情。塞西尔和班吉特所说的一切都让年轻的曼努埃尔感到十分惊奇，年轻人时常有种想要亲自前往奥斯曼帝国和非洲内陆的冲动，想要亲眼见见异国的风情和大自然的魅力。

    船队终于准备完毕，曼努埃尔向父母亲辞行，独自前往港口，若奥依旧像曼努埃尔第一次远航一样叮嘱他要注意安全，特意告诉年轻人如果他能够前往大明国，要替他去看望郑安，若奥亲自检查了船只、给养和货物，尤其是柠檬汁和淡水是否准备得充足，以免水手们受到败血症的困扰。在确定船队状况良好后，若奥表示他和艾米莉娜不会前往港口给曼努埃尔送行，他会和艾米莉娜在伯爵府邸等着曼努埃尔回来。

    曼努埃尔登上旗舰，再度望了望里斯本的大地，命令水手们起航，船队离陆地越来越远，曼努埃尔的心再度悲伤起来，他把自己锁在船长室里，盘算着怎样度过这孤独的漫长时光。

    船队的航行还算顺利，进入非洲海域后没有遇到太大麻烦，这次暴风雨似乎也不再侵扰曼努埃尔的船队，天气异常的好。船队首先前往加那利群岛，再南下前往绿角，在圣多美港补给后，前往卢安达。